本發(fā)明屬于分子生物學(xué)領(lǐng)域，特別涉及與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記的應(yīng)用。

背景技術(shù)：

1、社會(huì)的快速發(fā)展和機(jī)械化程度推進(jìn)，讓馬在勞役、交通等方面的傳統(tǒng)作用逐漸淡化，馬的功能開(kāi)始向綜合文化、體育休閑及旅游為一體的現(xiàn)代馬業(yè)轉(zhuǎn)型。隨著我國(guó)現(xiàn)代馬業(yè)的日趨發(fā)展與完善，人們對(duì)體育競(jìng)技、娛樂(lè)健身的關(guān)注度越來(lái)越高。近年來(lái)，國(guó)內(nèi)對(duì)競(jìng)技用馬、速度賽馬、速步賽馬、長(zhǎng)途耐力賽馬和娛樂(lè)用馬的需求量也不斷增大，國(guó)家把畜牧業(yè)發(fā)展也作為民生產(chǎn)業(yè)納入了重要日程。

2、由于毗鄰阿勒泰、塔城、伊寧等傳統(tǒng)養(yǎng)馬大區(qū)，博爾塔拉蒙古自治州（以下簡(jiǎn)稱博州）長(zhǎng)期養(yǎng)殖哈薩克馬。哈薩克馬具有力量大、耐粗飼的優(yōu)點(diǎn)，但其競(jìng)技能力與國(guó)內(nèi)外優(yōu)秀品種差距較大，無(wú)法滿足現(xiàn)代競(jìng)技賽馬需要。近年來(lái)博州通過(guò)引入純血馬以及伊犁馬等國(guó)內(nèi)外優(yōu)秀品種用來(lái)雜交改良當(dāng)?shù)氐墓_克馬，取得了一些成效，但由于這種傳統(tǒng)的雜交育種方式周期長(zhǎng)，進(jìn)展緩慢，而且效率比較低，導(dǎo)致博州地區(qū)馬匹的優(yōu)質(zhì)種源數(shù)量少而且生產(chǎn)性能不高，已成為制約當(dāng)?shù)伛R產(chǎn)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵問(wèn)題。

3、馬匹體型結(jié)構(gòu)是影響馬匹競(jìng)賽性能的重要因素之一，具有適宜的體型結(jié)構(gòu)的競(jìng)技動(dòng)物不僅具有良好的實(shí)用價(jià)值，在育種繁殖中也是一個(gè)重要的評(píng)估指標(biāo)。研究表明，體高、體長(zhǎng)、胸圍等體尺指標(biāo)與賽馬成績(jī)顯著相關(guān)，胸圍與5000?m速步賽的相關(guān)系數(shù)最大，而且呈極顯著相關(guān)性。中長(zhǎng)距離比賽要求馬匹有一定持久力，對(duì)心肺功能的要求較短途速度馬更高。馬匹胸圍越大，胸深越深，胸腔容積就越大，心肺越發(fā)達(dá)，供氧能力就越強(qiáng)，在中長(zhǎng)距離比賽中可以使馬匹更加穩(wěn)健地維持或者增加步長(zhǎng)，從而在更短的時(shí)間完成比賽。挖掘與鑒定影響馬匹胸圍性狀的關(guān)鍵基因或位點(diǎn)，通過(guò)分子標(biāo)記輔助選擇可以加快中長(zhǎng)距離比賽馬匹的定向選育進(jìn)展。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明篩選出了三個(gè)與馬匹胸圍性狀顯著相關(guān)的snp標(biāo)記，通過(guò)檢測(cè)以上三個(gè)snp標(biāo)記的基因型可以輔助賽馬或賽馬種馬選育，在馬駒階段定向選留目標(biāo)基因型個(gè)體，作為后備賽馬或賽馬種馬培育管理?；诖?，本發(fā)明提供與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記的應(yīng)用。

2、第一方面，本發(fā)明提供與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記在（1）~（4）任一項(xiàng)中的應(yīng)用：

3、（1）鑒定或輔助鑒定馬匹胸圍性狀；

4、（2）制備鑒定或輔助鑒定馬匹胸圍性狀的產(chǎn)品；

5、（3）選育大胸圍的馬匹；

6、（4）制備選育大胸圍的馬匹的產(chǎn)品；

7、所述連鎖snp標(biāo)記包括snp1、snp2、snp3；

8、snp1在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,679,922?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs396976187；

9、snp2在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,067?bp，等位基因?yàn)閍或g，rs?id為rs395890483；

10、snp3在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,139?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs394326854。

11、第二方面，本發(fā)明提供檢測(cè)與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記的試劑在（1）~（4）任一項(xiàng)中的應(yīng)用：

12、（1）鑒定或輔助鑒定馬匹胸圍性狀；

13、（2）制備鑒定或輔助鑒定馬匹胸圍性狀的產(chǎn)品；

14、（3）選育大胸圍的馬匹；

15、（4）制備選育大胸圍的馬匹的產(chǎn)品；

16、所述連鎖snp標(biāo)記包括snp1、snp2、snp3；

17、snp1在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,679,922?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs396976187；

18、snp2在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,067?bp，等位基因?yàn)閍或g，rs?id為rs395890483；

19、snp3在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,139?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs394326854。

20、第三方面，本發(fā)明提供用于擴(kuò)增與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記的引物組在（1）~（4）任一項(xiàng)中的應(yīng)用：

21、（1）鑒定或輔助鑒定馬匹胸圍性狀；

22、（2）制備鑒定或輔助鑒定馬匹胸圍性狀的產(chǎn)品；

23、（3）選育大胸圍的馬匹；

24、（4）制備選育大胸圍的馬匹的產(chǎn)品；

25、所述連鎖snp標(biāo)記包括snp1、snp2、snp3；

26、snp1在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,679,922?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs396976187；

27、snp2在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,067?bp，等位基因?yàn)閍或g，rs?id為rs395890483；

28、snp3在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,139?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs394326854。

29、本發(fā)明的一些實(shí)施方式中，所述產(chǎn)品包括試劑盒、芯片、儀器中的一種。

30、第四方面，本發(fā)明提供一種鑒定或輔助鑒定馬匹胸圍性狀的方法，包括：

31、檢測(cè)受試個(gè)體基因組中與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記的基因型；

32、根據(jù)基因型預(yù)測(cè)受試個(gè)體的胸圍性狀：

33、所述連鎖snp標(biāo)記包括snp1、snp2、snp3；

34、snp1在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,679,922?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs396976187；

35、snp2在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,067?bp，等位基因?yàn)閍或g，rs?id為rs395890483；

36、snp3在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,139?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs394326854。

37、本發(fā)明的一些實(shí)施方式中，檢測(cè)受試個(gè)體基因組中與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記的基因型的方法為全基因組測(cè)序法、pcr法、基因芯片法、snapshot法中的任意一種。

38、第五方面，本發(fā)明提供一種選育馬匹的方法，包括：

39、檢測(cè)受試個(gè)體基因組中與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記；

40、若受試個(gè)體基因組中所述的與馬匹胸圍相關(guān)的snp標(biāo)記為ccaagg基因型或ccaggc基因型，則將受試個(gè)體作為后備賽馬培育管理；

41、若受試個(gè)體基因組中所述的與馬匹胸圍相關(guān)的snp標(biāo)記為cgaggc基因型，則將受試個(gè)體淘汰；

42、所述連鎖snp標(biāo)記包括snp1、snp2、snp3；

43、snp1在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,679,922?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs396976187；

44、snp2在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,067?bp，等位基因?yàn)閍或g，rs?id為rs395890483；

45、snp3在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,139?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs394326854。

46、第六方面，本發(fā)明提供一種選育賽馬種馬的方法，包括：

47、檢測(cè)受試個(gè)體基因組中與馬匹胸圍性狀相關(guān)的連鎖snp標(biāo)記；

48、若受試個(gè)體基因組中所述的與馬匹胸圍相關(guān)的snp標(biāo)記為ccaagg基因型或ccaggc基因型，則將受試個(gè)體作為賽馬種馬培育管理；

49、若受試個(gè)體基因組中所述的與馬匹胸圍相關(guān)的snp標(biāo)記為cgaggc基因型，則直接淘汰；

50、所述連鎖snp標(biāo)記包括snp1、snp2、snp3；

51、snp1在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,679,922?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs396976187；

52、snp2在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,067?bp，等位基因?yàn)閍或g，rs?id為rs395890483；

53、snp3在馬基因組第13號(hào)染色體dna第26,680,139?bp，等位基因?yàn)閏或g，rs?id為rs394326854。

54、本發(fā)明的一些實(shí)施方式中，所述受試個(gè)體為馬駒。

55、本發(fā)明的一些實(shí)施方式中，所述受試個(gè)體或其親本為博州地區(qū)的馬匹。

56、與現(xiàn)有技術(shù)相比，本發(fā)明至少具有如下有益效果：

57、1.通過(guò)檢測(cè)本發(fā)明提供的三個(gè)snp標(biāo)記的基因型輔助賽馬選育，可在馬駒階段定向選留ccaagg基因型的個(gè)體，作為中長(zhǎng)距離速步賽的后備賽馬或賽馬種馬培養(yǎng)。定向選留ccaggc基因型的個(gè)體，作為中長(zhǎng)距離速步賽的后備賽馬培養(yǎng)。

58、2.本發(fā)明篩選出的兩個(gè)snp標(biāo)記緊密連鎖，在分子育種工作中，使用多個(gè)相互連鎖的snp標(biāo)記較單個(gè)snp標(biāo)記具有更高的靈敏度和精確度，從而提高選種的準(zhǔn)確性，進(jìn)一步加快遺傳進(jìn)展。